Liga al GIT
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Buen día, ya como ultimo semestre decide
escribir una tesis que entra como modulo de investigación y me cubre todos los
créditos necesarios para liberar el semestre sin ningún problema. A esta Tesis
le estaremos dedicando 8 hrs. diarias para estar presentando avances semanales
y que para mayo-junio este ya finalizada.
Todos los avances los estará supervisando la Dra. Elisa
Schaeffer.
Primera Reunión
En esta platica se me explico de manera general
lo que se espera de la tesis, lo que se tiene que cumplir, como se va estar
trabajando y como se estará evaluando.
Además de varias cosas mas que les voy a ir
compartiendo en las siguientes entradas.
La forma de trabajar será mediante 3 formas:
- Blog: Aquí estaremos documentando cada
semana avances generales sobre la tesis, links y/o apuntes que hayamos
hecho en esa semana.
- Dropbox: Aquí escribiremos la tesis(en
LaTeX). Los archivos están compartidos con la Dra. Elisa.
- Git: Todo lo relacionado con código.
Avances de la primera semana
Mi tesis se llama "Mediciones a
partir de imágenes" y su área es en odontología. Su nombre es muy
general porque su algoritmo no únicamente se puede enfocar a una área.
La investigación trata que a partir de una
imagen el programa sea capaz de reconocer ciertos aspectos "clave"
(de forma autónoma) a través de visión computacional y a partir de los puntos
encontrados empezar hacer mediciones (ángulos, distancia, etc) y con las datos
obtenidos y comparándolos con una "tabla maestra" sacar un
diagnostico previo.
La "tabla maestra" será llenada
por un experto en la materia y los resultados se compararán con esta.
Ahora el porque no únicamente se puede enfocar a
un área. Este mismo algoritmo se puede usar para detectar ángulos en paredes a
partir de una fotografía (área criminalística), hacer simulaciones de como
quedará un lugar después aplicar cierto efecto a cierto ángulo (simulaciones),
etc.
El programa esta pensado para ser una aplicación
de escritorio escrito en python por ser el lenguaje que en
estos momentos domino con facilidad. Pero no hay problema en moverse de
lenguaje. Siempre y cuando haya mejores librerías o la velocidad de
procesamiento sea mejor.
De las librerías que se utilizaran:
- PIL: Por su facilidad de jugar con
imágenes.
- OpenCV: Se combinara con PIL para jugar
con filtros sobre imágenes y todo lo relacionado con pre-procesamiento.
- Pyside: Todo lo relacionado con
interfaz gráfica.
- Gnuplot: Para mostrar estadísticas y
resultados.
Trabajos relacionados.
Directamente no existe un programa/aplicación
que haga lo mismo o casi lo mismo que yo, pero existen varios programas que su
algoritmo es algo parecido.
Un ejemplo es Image Measurement[1], es una aplicación que recibe como entrada una fotografía. El
usuario debe seleccionar las unidades de medición y sobre la foto tu puedes
hacer puntos para saber sus perímetros, áreas, longitudes y la APP calcula todo
base a las unidades de medición.
Otra aplicación que me pareció interesante fue Multitool Measure Suite[2], esta aplicación a partir de una imagen tu podías agregar líneas,
triángulos, formar tus figuras y te arrojaba distancias y ángulos. Las
dimensiones se actualizaban de forma directa cuando modificabas la dimensión de
la figura.
Un articulo que es relacionado con la que voy
hacer, es detectar cáncer a partir de imágenes histopatológicas, es un trabajo
completo usa técnicas de visión computacional, filtros y umbrales. Además que
agregan una red neuronal para que el sistema este aprendiendo. Ellos
pre-procesan la imagen original y a partir de hay buscan patrones para dar un
diagnostico. Al problema es que no dice cuanto se tarda en hacer el
diagnostico.[3]
+15.20.30.png) |
| Imagen tomada del PDF "Automated cancer diagnosis based on histopathological images: a systematic survey" |
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